郑云 博士
教授，硕士生导师
一、工作学习经历
1994 - 1998 北京航空航天大学机械制造工程专业，工学学士
2002 -2002 新加坡基因组研究所，研究学习
2002 - 2005 新加坡南洋理工大学，博士
2005 - 2006 新加坡国立大学，研究员
2006 - 2009 美国华盛顿大学，博士后研究助理
2009 - 2013 复旦大学，副教授
2011.03- 04 美国俄克拉荷马州立大学，访问学者
2011.07- 08 新加坡南洋理工大学，访问教授
2013.04- 05 美国俄克拉荷马州立大学，访问学者
2013.11- 12 新加坡南洋理工大学，访问教授
2015.01- 02 澳大利亚悉尼科技大学，访问教授
2018.08- 09 美国华盛顿州立大学，俄克拉荷马州立大学，访问学者
2013 - 2019 千亿体育平台，副教授，PI
2014 - PLOS ONE，学术编辑
2017 - Frontiers in Genetics，学术编委
2018 第29届国际基因组信息学会议主席
2019 - 千亿体育平台，教授，PI
二、 研究领域
MicroRNA是一类最近发现的具有调控功能的重要非编码小RNA。我们目前的一些科研包括小RNA高通量测序数据分析，基于高通量测序的转录组分析，识别和鉴定microRNA在植物发育、抗逆和肝癌、结肠癌等疾病中的功能，癌症诊断新分子标记物的预测和验证，CHIP-seq数据分析，基因调控网络分析，SNP和疾病的分析，基因GO和信号通路分析，蛋白质互作网络分析。
三、 开设的课程
《计算生物学概论》、《生物信息学》
四、 代表性论文
1. Lifeng Xiang*, Yu Yin*, Yun Zheng*, Yanping Ma*, Yonggang Li*, Zhigang Zhao, Junqiang Guo, Zongyong Ai, Yuyu Niu, Kui Duan, Jingjing He, Shuchao Ren, Dan Wu, Yun Bai, Weizhi Ji#, Tianqing Li#. 2020. A developmental landscape of 3D-cultured human pre-gastrulation embryos.Nature, 577:537–542.
2. Qingyi Wang*, Zhigang Zhao*, Xiaotuo Zhang, Chenyu Lu, Shuchao Ren, Shipeng Li, Junqiang Guo, Peiran Liao, Bingbing Jiang, Yun Zheng#. 2019. Identifying MicroRNAs and Their Editing Sites in Macaca Mulatta.Cells, 8(7)
3. Xiaotuo Zhang*, Yong Zhang*, Taiyun Wang, Ziwei Li, Jinping Cheng, Haoran Ge, Qi Tang, Kun Chen, Li Liu, Chenyu Lu, Junqiang Guo, Binglian Zheng# and Yun Zheng#. 2019. A comprehensive map of intron branchpoints and lariat RNAs in plants.The Plant Cell, 31(5):956-973
4. Yun Zheng#, Li Liu, and Girish C. Shukla. 2017. A comprehensive review of web-based non-coding RNA resources for cancer research.Cancer Letters, 407:1-8
5. Yun Zheng#, Bo Ji, Renhua Song, Shengpeng Wang, Ting Li, Xiaotuo Zhang, Kun Chen, Tianqing Li, and Jinyan Li#. 2016. Accurate detection for a wide range of mutation and editing sites of microRNAs from small RNA high-throughput sequencing profiles.Nucleic Acids Research, 44(14): e123.
五、 主持项目
2010年-2012年上海市自然科学基金，项目编号10ZR1403000，主持人，10万元人民币
2009年-2012年复旦大学引进人才启动基金，主持人，45万元人民币
2013年- 千亿体育平台高端引进人才启动基金，主持人，150万元人民币
2015年-2018年国家自然科学基金，项目名称“基于生物信息学的植物中分段生成的小干扰RNA的识别、功能和进化研究”，
项目编号31460295,主持人，50万元人民币
2016年-2018年复旦大学遗传工程重点实验室开发课题，项目编号SKLGE-1511，主持人，6万元人民币
2018年-2021年国家自然科学基金，项目名称“通过集成分析小RNA和基因组高通量测序数据识别人类和灵长类疾病模型
microRNA的编辑和突变”，项目编号31760314，主持人，直接经费39万元人民币
2018年-2021年复旦大学遗传工程重点实验室开发课题，项目编号SKLGE-18141，主持人，8万元人民币
2018年-2021年国家重点研发计划，项目编号2018YFA0108502，研究骨干，承担金额100万元人民币
六、 荣誉、奖励及参加学术团体的情况
2017年09月 第16届国际生物信息学会议BMCGenomics最佳论文奖
2013年11月 新加坡南洋理工大学Visiting Professorship
2013年04月 俄克拉荷马州立大学Visiting Scholarship
2011年10月 海南省杰出自然科学论文一等奖
2011年07月-08月 新加坡南洋理工大学Visiting Professorship
2011年03月-04月 俄克拉荷马州立大学Visiting Scholarship
2006年08月-2009年01月华盛顿大学圣路易斯Postdoctoral Fellowship
2005年12月-2006年08月 新加坡国立大学Postdoctoral Fellowship
2002年09月-2005年09月 新加坡南洋理工大学Fellowship
五、 联系方式
地址：昆明市呈贡区千亿体育平台灵长类转化医学研究院（650500）
电话： 0871-65918047 86-13908869783
E-mail：zhengyun5488@gmail.com
Websites:https://publons.com/researcher/2698852/yun-zheng/
